STHNLAB / МЕТОДЫ И МАТЕРИАЛЫ

Как работать с консолью

Каждый следующий вывод отделён от исходных наблюдений.

Маршрут исследования

  1. О варианте. Выберите ген и вариант. Биологическое описание гена не доказывает функцию выбранного варианта.
  2. Частоты. Посмотрите конкретный аллель, популяцию, исходную частоту и AC/AN. Не объединяйте разные аллели в одно значение.
  3. Качество данных. Разберите отсутствие счётчиков, расхождения и неоднозначные метки.
  4. Светофор. Три отдельных сигнала показывают научное обоснование, реализуемость и качество данных. Каждый цвет сопровождается причиной и ограничением; общего вердикта нет.
  5. Научное обоснование. Выберите подготовленную пару мишень–модальность. Здесь нет рейтинга или универсальной рекомендации.
  6. Отчёт. Скачайте наблюдения, флаги, источники и принятые допущения одним Markdown-файлом.

Значение показателей

max min(f, 1−f) используется как индекс для навигации по набору. Он не объявляется подтверждённой MAF конкретного аллеля. Порог 1% — фильтр интерфейса, не граница патогенности или применимости исследования.

Локальный запуск

python siRNA_Lab/app.py --port 8780
python GAPmAP/app.py --port 8770

Офлайн-файл prilozhenie.html открывается напрямую в браузере. Сторонние библиотеки для консоли не нужны.

Обновление данных и сборка

python scripts/sync_research_snapshot.py
node siRNA_Lab/web/keys8/files/tests.js --json
python scripts/build_research_materials.py
python scripts/build_offline_console.py
python scripts/check_project.py

Релиз не должен менять рабочие базы и пользовательские отчёты. Пересборка снимка сохраняет исходные поля; исправлять их без первоисточника нельзя.